חומרי גלם אורגניים של רוטב סויה חייבים לעמוד בדרישות הבאות: פולי סויה וחיטה חייבים להגיע משטחים חקלאיים שלא השתמשו בחומרי הדברה או דשנים כימיים במשך יותר משנתיים, והזרעים לא עברו שינוי גנטי; השימוש בחומרים מסונתזים כימיים אסור במהלך גידול היבול, ומי השקיה חייבים לעבור בדיקות מתכות כבדות.
חלק מהמוצרים משתמשים בחומרי גלם טבעיים של גידולים פראיים שנאספים באמצעות מערכות ייצור חקלאות אורגניות או שיטות אורגניות. אזור האיסוף חייב להיות נקי ממקורות זיהום תעשייתיים, וכמות האיסוף לא תעלה על כושר הנשיאה בר-קיימא של המערכת האקולוגית.
נעשה שימוש במערכת תסיסה מיקרוביאלית, כאשר התהליך העיקרי כולל שלושה שלבים:
שלב יצירת קוג'י-: באמצעות זני Aspergillus oryzae שאינם-GMO, הטמפרטורה נשלטת ב-28-32 מעלות ולחות ב-80%-85% באמצעות ציוד לייצור קוג'י דיסק, וקוג'י איכותי נוצר לאחר 48 שעות של טיפוח.
שלב התסיסה: לאחר ערבוב עם מי מלח, התערובת מועברת למיכל תסיסה-בטמפרטורה קבועה, תוך שמירה על סביבה של 35-40 מעלות לתסיסה מתמשכת. את המחית הופכים באופן קבוע בתקופה זו כדי לקדם פירוק חלבון.
שלב שלאחר-עיבוד: השמן הגולמי המתקבל לאחר הכבישה צריך להתיישן במיכלי ייבוש-באוויר בשמש- פתוחים ולחשוף אותו לאור השמש כדי לקדם את היווצרות האסטרים, וליצור ארומה ייחודית.
